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Premier dépistage moléculaire à grande échelle de Sarcocystis spp. en France chez des patients de ville adressés pour un examen parasitologique des selles

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Citations Cited by
  • Title:
    Premier dépistage moléculaire à grande échelle de Sarcocystis spp. en France chez des patients de ville adressés pour un examen parasitologique des selles
  • Author: Soares Almeida, João
  • Subjects: [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology ; Diarrhea ; Epidemiology ; Molecular ; Parasitic intestinal diseases ; Real-Time PCR ; Sarcocystis
  • Description: The actual prevalence and impact of Sarcocystis spp. in human intestinal infections remains largely unknown since the standard diagnostic tool, light microscopy, demonstrates limited sensitivity when compared to PCR methods. While a few recent studies have employed “in-house” molecular methods, this study represents the first large-scale survey, to the best of our knowledge, involving human stool samples (n=1202). A total of 945 French outpatients who were referred for a parasitological stool examination were screened for Sarcocystis spp. infection by an “in-house” quantitative PCR targeting the 18S ribosomal RNA (18S rRNA). Positive samples where then confirmed by semi-nested PCR targeting the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene for species identification and phylogenetic analysis. A total of 10 patients were positive for Sarcocystis hominis, leading to a prevalence of 1.1%. Phylogenetic analysis against other Sarcocystis spp. strains collected in the laboratory showed a clear branching that could indicate a novel species with zoonotic potential. This study consolidates the diagnostic reliability of these methods and sheds light on the comprehensive impact of Sarcocystis spp. on human health. CONTEXTE : les Sarcocystis spp. sont des protozoaires intracellulaires largement répandus à cycle de vie comprenant deux hôtes obligatoires et responsables d'infections chez ces derniers, y compris le bétail et les êtres humains. Traditionnellement, le diagnostic de la sarcocystose intestinale humane repose sur l'analyse en microscopie optique d'échantillons de selles pour détecter les oocystes/sporocystes. Cependant, la sensibilité de cette méthode reste largement inconnue et semble inadaptée pour diagnostiquer les infections à un stade aigu, où des symptômes intestinaux peuvent se manifester malgré la présence d'un nombre minimal d'oocystes/sporocystes.OBJECTIF : i) obtenir les premières données de prévalence de sarcocystose intestinal en France par diagnostic moléculaire ii) apporter à la littérature des nouvelles séquences génétiques de Sarcocystis spp.MÉTHODE : 945 patients provenant de toute la France et ayant un examen parasitologique des selles prescrit en ambulatoire ont été dépisté à l’aide d’une PCR quantitative ciblant le gène de l’ARN 18S. Les dépistages positifs ont ensuite été confirmés par une PCR seminichée ciblant le gène de la sous-unité I de la cytochrome c oxydase mitochondriale (COX1) pour l'identification d’espèce et comparés à d’autres souches isolées en France pour l’analyse phylogénétique.RÉSULTATS : les résultats ont montré une prévalence de 1.1 % avec une seule espèce en cause : Sarcocystis hominis. L’analyse phylogénétique révèle la présence d’une potentielle nouvelle espèce à pouvoir zoonotique.CONCLUSION : cette étude apporte des premiers éléments sur l’épidémiologie des sarcocystoses intestinales en France. À termes, l’utilisation d’une méthode de diagnostique fiable permettra d’éclairer l'impact global de cette parasitose encore méconnue sur la santé humaine.
  • Publisher: HAL CCSD
  • Creation Date: 2023
  • Language: English
  • Source: Dumas (Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance)
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