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Comparison of manual and semi-automatic photo-identification methods for the individual monitoring of the common European adder (Vipera berus)

Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License ;DOI: 10.48716/bullshf.182-6

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Citations Cited by
  • Title:
    Comparison of manual and semi-automatic photo-identification methods for the individual monitoring of the common European adder (Vipera berus)
  • Author: Givord-Coupeau, Bérénice ; Rey, Gaëtan
  • Subjects: Environmental Sciences
  • Description: In order to optimize individual identification protocols for the common European adder (Vipera berus), a study was conducted on photo-identification methods to compare a manual method and three semi- automatic software integrating characteristic pattern matching algorithms (APHIS, I3S Pattern and Wild- ID). To compare these methods, the cephalic scales of the individuals were photographed and a database of 192 images was created. On the one hand, the reliability of these methods was evaluated by measuring the false negatives rate and rank-weighted true positives rate. On the other hand, the rapidity of the methods was evaluated by measuring the average time required for each software for the photos pre-processing, analysis and match verification steps. At the end of this study, the APHIS software was considered more suitable for the individual recognition of Vipera berus, having reached a reliability value of 100% and presenting a correct speed (average of 86.5 seconds per image). Dans une optique d' optimisation des protocoles d'identification pour le suivi individuel de la Vipère péliade (Vipera berus), une étude a été conduite sur les méthodes de photo-identification afin de comparer une méthode manuelle et trois logiciels semi-automatiques intégrant des algorithmes de comparaison de motifs caractéristiques (APHIS, I3S Pattern et Wild-ID). Pour comparer ces méthodes, les écailles céphaliques des individus ont été photographiées et une base de données de 192 images a été constituée. D'une part, la fiabilité de ces méthodes a été évaluée en mesurant les taux de faux négatifs et de vrais positifs pondérés par les rangs. D'autre part, la rapidité des méthodes a été évaluée en mesurant le temps moyen nécessaire à chaque logiciel pour les étapes de prétraitement des images, d'analyse et de vérification des correspondances. A l'issue de cette étude, le logiciel APHIS a été jugé plus adapté à la reconnaissance individuelle de Vipera berus, ayant atteint une valeur de fiabilité de 100 % et présentant une rapidité correcte (86,5 secondes par image en moyenne).
  • Creation Date: 2023
  • Language: English
  • Identifier: DOI: 10.48716/bullshf.182-6
  • Source: Hyper Article en Ligne (HAL) (Open Access)
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