skip to main content
Guest
My Research
My Account
Sign out
Sign in
This feature requires javascript
Library Search
Find Databases
Browse Search
E-Journals A-Z
E-Books A-Z
Citation Linker
Help
Language:
English
Vietnamese
This feature required javascript
This feature requires javascript
Primo Search
All Library Resources
All
Course Materials
Course Materials
Search For:
Clear Search Box
Search in:
All Library Resources
Or hit Enter to replace search target
Or select another collection:
Search in:
All Library Resources
Search in:
Print Resources
Search in:
Digital Resources
Search in:
Online E-Resources
Advanced Search
Browse Search
This feature requires javascript
Search Limited to:
Search Limited to:
Resource type
criteria input
All items
Books
Articles
Images
Audio Visual
Maps
Graduate theses
Show Results with:
criteria input
that contain my query words
with my exact phrase
starts with
Show Results with:
Search type Index
criteria input
anywhere in the record
in the title
as author/creator
in subject
Full Text
ISBN
ISSN
TOC
Keyword
Field
Show Results with:
in the title
Show Results with:
anywhere in the record
in the title
as author/creator
in subject
Full Text
ISBN
ISSN
TOC
Keyword
Field
This feature requires javascript
Analyse du mécanisme d'action d'inhibiteurs ciblant l'activation allostérique du facteur œdématogène de Bacillus anthracis
Digital Resources/Online E-Resources
Citations
Cited by
View Online
Details
Recommendations
Reviews
Times Cited
External Links
This feature requires javascript
Actions
Add to My Research
Remove from My Research
E-mail
Print
Permalink
Citation
EasyBib
EndNote
RefWorks
Delicious
Export RIS
Export BibTeX
This feature requires javascript
Title:
Analyse du mécanisme d'action d'inhibiteurs ciblant l'activation allostérique du facteur œdématogène de Bacillus anthracis
Author:
Pitard, Irène
Subjects:
Allosteric inhibition
;
Anthrax
;
Bacillus cereus
;
Biologie structurale
;
Calmodulin
;
Calmoduline
;
Cristallographie
;
Dynamique moléculaire
;
Edema factor
;
Facteur oedémateux
;
HDX-MS
;
Inhibiteur allostérique
;
Molecular dynamics
;
NMR
;
RMN
;
Structural biology
;
X-ray
Description:
Le facteur œdémateux (EF), une toxine majeure de Bacillus anthracis, est activé par la calmoduline de l’hôte (CaM) pour produire des concentrations supra physiologiques d'AMP cyclique (AMPc) conduisant à une perturbation des voies de signalisation. L'interaction EF-CaM induit des changements conformationnels dans une région switch allostérique de EF conduisant à la formation du site catalytique fonctionnel. Des études antérieures in silico ciblant cette région switch, complétées par des données expérimentales, ont montré que les uréidoacides thiophènes (TUA) inhibent l’activité enzymatique de EF. Cependant, les connaissances sur le site de liaison et sur l'interaction étaient manquantes. Nous présentons ici une étude de l'interaction du TUA-diCl, le composé le plus actif, avec les protéines EF, CaM et le complexe EF-CaM à l'aide d’essais biochimiques couplés à des méthodes biophysiques et de modélisations moléculaires. Le TUA-diCl interagit avec EF isolé, le complexe EF-CaM et de manière inattendue avec CaM. L’étude du site de liaison entre le composé TUA-diCl et la protéine CaM par RMN indique que le composé se lie aux patchs hydrophobes de CaM qui deviennent accessibles lorsque la CaM est complexée par les ions calciums. Ceci entraîne un compactage de la structure de CaM et des changements de la dynamique interne de la protéine. Les données enzymatiques, de fluorescence et de RMN montrent que l'inhibition d'EF est due à l'interaction du composé sur EF et ne dépend pas de la présence de CaM. Des expériences de compétition entre le TUA-diCl et l’inhibiteur du site catalytique EF 2’-MANT-3’-dATP, indiquent que TUA-diCl est un inhibiteur allostérique de EF. Les expériences HDX-MS ont révélé que le TUA-diCl se lierait au domaine hélicoïdal de EF, une région critique pour l'insertion de CaM. De plus, des approches in silico ont mis en évidence plusieurs sites de liaison possible dans le domaine hélicoïdal. Par conséquent, TUA-diCl représente une nouvelle classe d'inhibiteurs de EF avec un mécanisme d'action allostérique et ouvrant la voie vers la conception de molécules thérapeutiques innovantes. Edema factor (EF), a major Bacillus anthracis toxin, is activated by host calmodulin (CaM) to produce supraphysiological concentrations of cyclic AMP (cAMP) thus perturbing intracellular signaling. The EF-CaM interaction induces conformational changes in an allosteric switch region of EF that lead to the formation of the catalytic site. Previous in silico studies targeting this switch region, complemented with experimental data, showed that thiophen ureidoacids (TUA) inhibit the enzyme catalytic activity. However, knowledge of the binding site and inhibition mode of TUA compounds are still lacking. Here, we characterize the interaction of the most active TUA compound (TUA-diCl) with EF, CaM and EF-CaM using biochemical assays coupled to biophysical methods and molecular modeling. We show that TUA-diCl interacts with EF, EF-CaM and unexpectedly with CaM. Mapping of the binding site by NMR, showed that TUA-diCl binds to the exposed hydrophobic patches of calcium loaded CaM, causing the compaction and changes in internal dynamics of the protein. Importantly, enzymatic, fluorescence and NMR data show that EF inhibition is due to the interaction of the compound with EF and is CaM-independent. Furthermore, competition experiments between TUA-diCl and the EF catalytic-site inhibitor 2’-MANT-3’-dATP, indicate that TUA-diCl is an allosteric inhibitor of EF. HDX-MS identifies a putative binding site of TUA-diCl on the helical domain of EF, a critical region for CaM insertion. Several possible binding pockets in the helical domain are analyzed in silico. TUA-diCl represents a new class of EF inhibitors with an allosteric mechanism, opening the way towards the design of innovative therapeutic compounds.
Creation Date:
2020
Language:
English
Source:
Theses.fr
This feature requires javascript
This feature requires javascript
Back to results list
This feature requires javascript
This feature requires javascript
Searching Remote Databases, Please Wait
Searching for
in
scope:(TDTS),scope:(SFX),scope:(TDT),scope:(SEN),primo_central_multiple_fe
Show me what you have so far
This feature requires javascript
This feature requires javascript